پناهگاه حیاتوحش قمیشلو با مساحتی بالغبر 89هزار هکتار در سال 1374 طی مصوبه شورای عالی محیطزیست به مجموعه مناطق تحت مدیریت سازمان حفاظت محیطزیست استان پیوست.
طی سالهای اخیر و پس از خشک شدن رودخانه زایندهرود متعاقبا تالاب گاوخونی بهمرور کاملا خشک شد و در حال حاضر غیر از مختصری که از پساب فاضلاب شرق اصفهان به آن میرسد ورودی آب دیگری ندارد.